Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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