Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdca4Q9CWM2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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