Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl3Q9CUS9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl3Q9CUS9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl3Q9CUS9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl3Q9CUS9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl3Q9CUS9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl3Q9CUS9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl3Q9CUS9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl3Q9CUS9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl3Q9CUS9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl3Q9CUS9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl3Q9CUS9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl3Q9CUS9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl3Q9CUS9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl3Q9CUS9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl3Q9CUS9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms