Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930519P11RikQ9CUJ8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms