Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Fcf1Q9CTH6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Fcf1Q9CTH6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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