Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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