Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms