Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ykt6Q9CQW1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms