Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms