Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ergic3Q9CQE7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ergic3Q9CQE7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ergic3Q9CQE7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ergic3Q9CQE7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ergic3Q9CQE7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ergic3Q9CQE7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms