Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms