Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
StambpQ9CQ26 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms