Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsmce3Q9CPR8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms