Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms