Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms