Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc12a9Q99MR3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms