Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprtQ99M80 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprtQ99M80 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms