Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TriobpQ99KW3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TriobpQ99KW3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms