Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms