Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Def8Q99J78 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms