Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms