Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms