Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim59Q922Y2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms