Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms