Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Afg3l1Q920A7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Afg3l1Q920A7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Afg3l1Q920A7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Afg3l1Q920A7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Afg3l1Q920A7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Afg3l1Q920A7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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