Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smarca5Q91ZW3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarca5Q91ZW3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms