Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atpaf2Q91YY4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms