Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms