Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms