Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Ccdc115Q8VE99 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc115Q8VE99 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms