Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cul7Q8VE73 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms