Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Smg8Q8VE18 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Smg8Q8VE18 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Smg8Q8VE18 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Smg8Q8VE18 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Smg8Q8VE18 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Smg8Q8VE18 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Smg8Q8VE18 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Smg8Q8VE18 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Smg8Q8VE18 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Smg8Q8VE18 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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