Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrkQ8VDU5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms