Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rprd1aQ8VDS4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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