Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uhrf1Q8VDF2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms