Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fyco1Q8VDC1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fyco1Q8VDC1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms