Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms