Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD6

Reep2, Receptor expression-enhancing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep2Q8VCD6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep2Q8VCD6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms