Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rapgef3Q8VCC8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Rapgef3Q8VCC8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Rapgef3Q8VCC8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rapgef3Q8VCC8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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