Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ccdc58Q8R3Q6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ccdc58Q8R3Q6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ccdc58Q8R3Q6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ccdc58Q8R3Q6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ccdc58Q8R3Q6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ccdc58Q8R3Q6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ccdc58Q8R3Q6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ccdc58Q8R3Q6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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