Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Nup58Q8R332 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Nup58Q8R332 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Nup58Q8R332 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Nup58Q8R332 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Nup58Q8R332 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Nup58Q8R332 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Nup58Q8R332 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms