Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mkl1Q8K4J6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms