Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brd3Q8K2F0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms