Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms