Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Abcf3Q8K268 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Abcf3Q8K268 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Abcf3Q8K268 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf3Q8K268 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Abcf3Q8K268 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Abcf3Q8K268 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Abcf3Q8K268 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Abcf3Q8K268 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Abcf3Q8K268 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Abcf3Q8K268 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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