Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sde2Q8K1J5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms