Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit1Q8K099 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit1Q8K099 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit1Q8K099 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit1Q8K099 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit1Q8K099 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit1Q8K099 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit1Q8K099 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit1Q8K099 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit1Q8K099 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit1Q8K099 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit1Q8K099 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit1Q8K099 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit1Q8K099 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit1Q8K099 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit1Q8K099 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit1Q8K099 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms