Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg3l2Q8JZQ2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Afg3l2Q8JZQ2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms