Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip10Q8CJ53 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms