Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIR4

Trpm6, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm6Q8CIR4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Trpm6Q8CIR4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Trpm6Q8CIR4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trpm6Q8CIR4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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